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二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室裝修設(shè)計(jì):行業(yè)規(guī)范

文章出處:技術(shù)支持|閱讀量:1512|發(fā)表時(shí)間:2020-09-02

二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室,是一種用于基因檢測(cè)(高通量測(cè)序檢測(cè))的實(shí)驗(yàn)室,建設(shè)二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的重點(diǎn),主要在設(shè)計(jì)布局分區(qū)、 結(jié)構(gòu)材料、氣壓調(diào)節(jié)、消毒、照明、傳遞窗幾個(gè)方面。

一、二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的設(shè)計(jì)布局分區(qū)

二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的設(shè)計(jì)分區(qū),主要將實(shí)驗(yàn)室劃分為4個(gè)區(qū)域,即:試劑準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)、文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)、測(cè)序區(qū)。

1. 試劑準(zhǔn)備區(qū)

NGS實(shí)驗(yàn)室試劑準(zhǔn)備區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:

(1)區(qū)域功能:用于實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目所需試劑的配制、分裝和保存。

(2)儀器配備:必須配備加樣器、冰箱、分析天平、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)等儀器設(shè)備。

2. 標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)

NGS實(shí)驗(yàn)室標(biāo)本與文庫(kù)制備區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:

(1)區(qū)域功能:用于血液處理、血漿制備、DNA提取、DNA片段化、DNA樣品的純化、DNA濃度檢測(cè)、末端修復(fù)、接頭連接、構(gòu)建樣本的測(cè)序文庫(kù)。

(2)儀器配備:必須配備冷凍離心機(jī)、微量臺(tái)式離心機(jī)、掌上三管離心機(jī)、渦旋震蕩器、垂直混合儀、移液器、可移動(dòng)紫外燈、生物安全柜、冰箱、托盤天平、Qubit 2.0核酸定量?jī)x、電腦(可連接互聯(lián)網(wǎng))、條形碼打印機(jī)、普通打印機(jī)、掃描槍、磁力架等儀器設(shè)備。

3. 文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)

NGS實(shí)驗(yàn)室文庫(kù)擴(kuò)增與檢測(cè)區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:

(1)區(qū)域功能:用于文庫(kù)構(gòu)建后的PCR擴(kuò)增與純化、文庫(kù)濃度檢測(cè)、文庫(kù)的混合及混合后的質(zhì)檢分析。

(2)儀器配備:必須配備PCR儀、QPCR儀、Qubit2.0核酸定量?jī)x、可移動(dòng)紫外燈、超凈工作臺(tái)、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、UPS、冰箱、移液器、磁力架等儀器設(shè)備。

4. 測(cè)序區(qū)

NGS實(shí)驗(yàn)室測(cè)序區(qū)的區(qū)域功能及儀器配備如下:

(1)區(qū)域功能:用于測(cè)序模板制備,如乳液PCR與磁珠富集回收,以及上機(jī)測(cè)序、數(shù)據(jù)分析、報(bào)告審核及發(fā)放。

(2)儀器配備:必須配備高通量測(cè)序儀、PC電腦、打印機(jī)、UPS、恒溫金屬浴、純水儀、冰箱、微量臺(tái)式離心機(jī)、渦旋振蕩器、移液器、超凈工作臺(tái)、可移動(dòng)紫外燈、磁力架、PCR儀等儀器設(shè)備。

二、二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的主體結(jié)構(gòu)材料

二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)裝修要以彩鋼板與鋁合金材料為主體建材,室內(nèi)陰角與陽(yáng)角采用鋁合金50內(nèi)圓角鋁,這樣做的好處是內(nèi)部結(jié)構(gòu)牢固、密封性好,且不易污染、積塵。

三、二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的氣壓調(diào)節(jié)

二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室在氣壓調(diào)節(jié)上,要在實(shí)驗(yàn)區(qū)的外墻和各扇門上安裝風(fēng)量可調(diào)的回風(fēng)口,空氣通過(guò)回風(fēng)口向室內(nèi)換氣。

四、二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的消毒與照明

在消毒上,二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的實(shí)驗(yàn)區(qū)、緩沖區(qū)頂部、傳送窗內(nèi)部要配備用于消毒的紫外燈。如果要對(duì)實(shí)驗(yàn)桌進(jìn)行局部消毒,還要配備移動(dòng)紫外線燈;在照明上,照明設(shè)備必須不積塵、易清潔才行,這里SAREN三仁建議配備凈化燈具。

五、二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室的傳遞窗

傳遞窗分為機(jī)械連鎖型與電子連鎖型,二代測(cè)序NGS實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)裝修建議配備前者,以便確保樣本與試劑在傳遞過(guò)程中不會(huì)受到污染。

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